En el submit deberas usar el metodo de envio Post supongo para realizar lo que quieres, aunque nunca he pasado varibales  para usarlas en Javascript de manera oculta, asi que no se si tendra una problematica especial.

Prueba con el metodo Post.

gracias por sus sugerencia me sirvieran si las variables que tengo que pasar fueran a otra pagina a traves del submit,  lo que pasa es que las tengo que pasar a un popup que abro con la instruccion window.open, y segun lo que he investigado solo las puedo pasar a traves de la url, es decir:

www.hhh.com?uu=9&ff=99&yy=50

y no puedo pasarlas asi, no puedo dejar que se vean

lo que quiero saber es si alguien sabe como pasarlas al popup pero de manera oculta, ademas tengo el otro percanse de que la la pagina que llama al popup se encuentra en un servidor y el popup se encuentra en otro.

gracias al que pueda de verdad ayudarme estoy desesperada no encuentro solucion