No se a que te refieres dinamicamente, ni como funciona internamente la aplicacion que quieres migrar, tu descripcion es demasiado escueta..

Asi muy general te puedo decir, hacer la "fachada"(la Interfaz Grafica de Usuario) en html y lo demas ya depende de la aplicacion (portarla a lenguajes servidor, hacerte un .exe que actue como cgi al que se llame,ect...).