Bueno nose si te responde lo que voy a poner, pero por si acaso...

En la definición que hay en la wikipedia de applets, se dice como desventaja que éste tiene que estar firmado como confiable para que tenga acceso a más cosas (disco duro local, portapapeles...)

http://es.wikipedia.org/wiki/Applet_Java

Bueno si encuentro algo más que esté relacionado con lo qeu buscas lo volveré a postear.

Talueg!